「基本的に"クリタワのみ開放してる人口＜クリタワ以降も開放してる人口"とはなりえないのでアラルレに申請してる以上クリタワ率が高くなる」
まずこれは歴とした事実ですね、これを崩すには新規参入を一旦止めないとなので不可能です
ではこれをもってアラルレのクリタワ率を下げるにはどうすればよいかとなるとルーレットの仕様上クリタワ以外のアラレを指定して申請する人を増やすしかありません
それを可能とするには
①蒼天以降のアラレを開放するうまみを設ける
②特定のアラレへの突入ボーナスを設ける
の2択になると思います

①に関しては1度攻略したアラレには直接申請しないので行き当たりばったりの策になり、その間新規がクリタワを開放していくので最終的にはアラルレのクリタワ率を下げる対策にはなりません
②に関してはタレイアやモグコレが該当してますね。実際に火曜日やモグコレ期間のアラルレは該当アラレに当たる確率が高いと感じます
ただこれも一時的なものなので恒常的にクリタワ率を下げたいとなると青魔ログの週課のようにボーナス対象を設けるとかでしょうか

本来であれば空想帳がその役割だと思うのですが他のコンテンツでポイント稼いだ方が楽なのであまり機能してはいませんが……