細かいけどマケボ周りはこんな感じだと思う。

【税金】
出品者の売値にかかって徴収されるもの。
基本5%だけど、減税中の都市で出品&取引成立した場合は2%減税されて3%で済む。
(出品リテイナー数の少ない都市が減税対象になる)

【手数料】
購入者が売値に上乗せして支払うもの。
どこの都市で購入しても一律5%。
(以前は出品都市での購入時に手数料が免除されていたけど、パッチ5.2で免除システムが廃止された)