システム内部の事情は分からんので想像になりますが、
マテリアやカララントのようなものをトークン化して所持品と別側に置くと、キャラクターデータ領域にその情報を常時確保することが必要になるので難しいのではないかと。
スノウホワイト1個
ピュアホワイト12個
シャインゴールド0個
…
みたいな感じで130以上のカララント保有情報を保持しなきゃならんので大変なイメージ。マテリア足したら200以上かな？

それはそれとして、
マテリアは最新拡張＋一個前は削除したほうがいい気はします(今だとオメガアルテマ＋エクスメガを残す)
また、カララントは基本色はすべて1アイテムに統合してほしい(ローズピンクとラストレッドはどちらもカララント：レッドで染色可能みたいな)

あと個人的な感覚では、カバンの空きを増やしたところでこの手の悩みは尽きない気がする。