私が思った「大規模FCの人数に応じた票数」というのは
単純に所属人数分の票になるという意味ではなく
PLLで発表されたFCハウスへの応募権利のある人が、同FCから複数人応募できるというものです

100人のFCのうち応募できるのは一人だけとなれば
他の(サブキャラや幽霊メンバーではない)99人の権利が失われます
4人のFCであっても1人しか応募できなければ他の3人の権利が失われます

当然応募費用は人数分かかるものだと思っていますし
100人所属しているからと言って100人同時に応募しなければならないというものでもないです
また、同じ土地に同FCから複数人が応募し誰かが当選した場合は、他の人は落選扱いになるのが自然と思います