そもそもハイエンドコンテンツの最終目標が武器ってことに問題あるのかなって思ったりします。
最強のボスを倒すために必要な強い武器が、そのボスを倒したら落とすってことがおかしいですね。
取れたら次回から楽になる？そういう問題ではないですね。
バハ武器が、今で言う詩学武器のような位置付けなら、１～３層で武器と防具を強化してラスボスに挑むって意味で筋があうと思います。
クリアしたら確実にドロップする石と繊維だけで強化できるのはさすがに難易度として問題あるので調整する必要はありますが。