So ist es.
In den Gebieten selbst sind die Begleiter nur Zierde (oder zum angeben, wenn man ein besonders seltenes Tierchen hat )
Ansonsten sind die relativ nutzlos.

Die Kommandos für Deinen Chocobo sind halt in Abhängigkeit von der Situation und davon wie du ihn gelevelt hast zu verwenden:

Heiler-Chocobo --> heilen
DD(Angreifer)-Chocobo --> angreifen
Tank(Verteidiger)-Chocobo --> tanken (verteidigen)

Du kannst Deinem Chocobo aber auch Freie Haltung befehlen und er entscheidet dann selbst was er macht.

Es empfiehlt sich übrigens, immer nur eine Rolle gleichzeitig zu leveln (Heiler, Angreifer, Tank).

Ich persönlich bevorzuge z.B. als erste Rolle für den Chocobo den Heiler.

Zunächst lässt sich der Chocobo nur bis Stufe 10 leveln.
Danach musst Du ihm eine Thavnair-Zwiebel füttern um ihn auf Stufe 11 weiter zu leveln. Mit jeder weiteren Stufe musst Du ihm nach erreichen der erforderlichen XP eine weitere Zwiebel füttern.
So kannst Du Ihn dann bis maximal Stufe 20 leveln um ihm alle Rollen beizubringen.

Die Zwiebeln musst Du Dir am Marktbrett kaufen. (Auf Cerberus werden diese relativ stabil zwischen 200.000 und 260.000 Gil gehandelt).