自分もこっちのスレ（UI改善要望）で同じ要望を書き込んだけど、強制昇順表示をやめるなら特に問題出ないような気がする。
並び順を変えても番号は変わらないようにすればマクロやホットバーは影響を受けないはず。
マクロ一覧も左上から強制昇順表示じゃなくて、ホットバーみたいにドラッグ＆ドロップで動かせたら整理も楽そう。

と思ったけど無理なのかな、自分で並べ替えできるとなるとそれを記憶しておく必要もある(?)し(´ε｀；)ｳｰﾝ…