「所持品・アーマリーチェスト・ギアセット・愛蔵品キャビネット・遺失物管理人・リテーナー2人」以外に
預けておける場所は無かったと思います。
確認していただきたいのですが、AF防具を入手したのは 2012年11月01日(木) 6:00より前の事ですか?2012年11月01日(木) 6:00から最終セーブ用のメンテナンスが行われています。
この後の行動は一切反映されていません。
もし、そうであるなら、新生Lodestoneのサポートセンターのページから問い合わせてみてください。
(Lostしたアイテムを復旧するには、過去ログを調べたりする必要があるようなので、個別対応らしいです。)