フライングサーディンが同条件(物理属性のInstant)なので試してみましたがどちらも適用され火力も上がっていました。
なのでアビリティだから適用されない説は流石に通らないかと思います。
逆にフライングサーディンに適用されるのがおかしいのかもしれませんが