Die Kristallturmreihe solltest du auf jeden Fall schon man anfangen. Der Abschluss dieser Reihe ist ab einem bestimmten Punkt Voraussetzung um mit der Hauptgeschichte weiter zu machen.

Gleiches gilt für die 3 Primae Ifrit, Garuda und Titan in der Stufe "Götterdämmerung". Letzterer der 3 muss im Verlauf der Hauptgeschichte noch einmal besucht werden.