これはWindows7以降で起こる59Hz病というのですね。
OS側の仕様のようで、直すのには非公式なかなり手間の掛かる手順が要るようです。

プロパティ上では60Hzになっていても、実際には59Hzで動作しているという状態です。
(四捨五入？で表記上は60Hzになっているようです)
なので、59fps止まりになっちゃうんですよ。

OS再起動で運良く60Hzになるときもあれば、59Hzになってしまうときもあります。