これについてはたぶん開発側はログやギルの保有量を見てこの値段を決めたと思うのです。
リーブ一回の報酬以下で三国移動可能ならアニマ移動よりだいぶ割安です。

しかしプレイヤー心理からすると最大5000ギルは高く感じる。
何千万ギル持ってようが、5000ギル払うなら動かないでいようかな、と思ってしまう。
「移動すると損」という意識が働いてしまう以上、移動にはブレーキがかかるかもしれませんね。
うーんせめて三国間の物流がどうにかなればなぁ。
（まあ最初だけちょっと高く設定して、あとあとユーザーの声を聞いて下げていくという手かもしれませんか）