ヒラが弱いと部隊がすぐに壊滅するのである程度の強さはないと面白みがなくなると思います。
ただ、PvEとPvPで全ての仕様を別にしてもう一度考えてほしいと言っても無理でしょう。
PvE主体の人もいるのだし、ここで学をどうこうなんて話すとそちらにも害が出てしまいます。
ある程度のpvp用スキルの強さの変更等で変えるしかないと考えます。
ただ、もうひとつ提案するとしたら、ペット召喚するジョブに関しては召喚時に能力を少し下げるというのはどうですか?
召喚のdpsが下がるのは痛いですが、学の弱体化は出来ると思います。現状の召喚だって十分強いとは思ってるのでこれでなんとかバランスを取るのがひとつの考えかと思います。