同意します。
つい先ほど、Bが3分ほどの間まるまる8人いませんでした
その後全員がやばいと思ったのか驚異的な戦いで開幕すらリード、逆転勝利しましたが・・・。

本当にフェアに、と考えるならば
1、全陣営、設定人数(8/16/24)が補充されるまで作戦時間を無期限で延長する
これが理想です。
もしくは
2、補充待ちの陣営は、補充されるまでの間、全ステータスに欠員人数に応じたボーナス

このどちらかを入れて欲しいところです。