私もグリダニア開始のレガシーキャラで、開始早々巴術士ゲットのためにリムサ･ロミンサまで行こうとして、
船に乗れずに引き返したクチですが・・・

もし最初から船に乗れた場合、リムサ・ロミンサから新規で始めた初心者の方が、
ギルがたまる前に好奇心で船に乗ってザナラーンに渡ってしまい、
キャンプ・ホライズン辺りにホームポイントを設定して、往路の船賃もなくなると積んでしまうからではないでしょうか。
モンスターを倒してもギルは手に入りませんし、まだリテイナーも雇えないので市場でギルを調達することもできません。
あとはウルダハ周辺まで行って、簡単なクエストやFATEで金策するしかないでしょうか。

船の仕様の是非はともかくとして、こういったハマリ防止対策的な事情もあるかと思われます。