バランスが崩れることを懸念しての制限だということは重々理解していますが。
バランスを取らなければいけないのは大迷宮バハムートや極蛮神ぐらいですかね
これらの最難関コンテンツでのみフェニックスのおなどの制限を加えて　ほかの比較的ライト向けのコンテンツでは
無制限で使えても良いのではないでしょうか　と思います
また　最難関コンテンツでも緩和され超える力などが適用され、バランスを取る必要がなくなったら
使用を開放するなどしていけばいいと思います