ミッション等のBCの敵をパワーアップさせてチャレンジモードみたいなものを実装してみてはどうでしょうかね。
メリットデメリット無しで、ミッションがノーマルモード位の難易度でハードモード位難しくするなどして・・。

ミッションで1回しか登場しないとか、数回しか入る機会が無い場所とか　勿体無い気がします。