???層進む
コレが詳細に分かれていれば問題ないんじゃないですか？

1層進む ペナルティ発生率0%
2-3層進む ペナ発生率20%
4-6層進む ペナ発生率50%
7-10層進む ペナ発生率100%
11-20層進む ペナ発生率200% (二種類以上の制限が必ずかかる)
21-30層進む ペナ発生率300% (三種類以上の制限が必ずかかる)

おおさっぱですがこんな感じですかね
ようは、「一度に多く進もうとすると多重のペナルティで1層あたりの攻略が非常に困難になる」という方向で調整したらいいんじゃないですかっていう