現状ゲーム内で操作に使うデバイスはこの3つになると思います。
・ゲームパッドを主に使う
・キーボードを主に使う
・マウスを主に使う
これらの操作ではそれぞれ全く異なる道具が使われるので、
操作しているプレイヤーの指と手の動きもそれぞれに合わせて
全く違ったものになってくるのが当然です。
マウス向けにデザインされた操作性がゲームパッドをメインに
使っているユーザーに最適かと言ったら現実にはそれは非常に
無理があると思われますので、現状1種類しかない操作を
・ゲームパッド向け
・キーボード向け
・マウス主体向け
に完全にモード分けしてユーザーが選べるようにして下さい。
モードを分離することで ■■■向け を配慮して導入した操作が
●●●を使う主義 の人達の操作の妨げになるようなケースが
大幅に低減すると思います。