修理の概念があること自体は問題がないのでは？
UOの修理DEEDみたいな物があればそれで事足りると思いますよ
要はクラフターのスキルを修理専用のチケット化した物で
コレを使うと修理をそのクラフターのスキル値で修理できると言う物です

マテリアクラフトというのが入るようなので組み込む隙は無さそうですが
使い込んだ武器を芯材にすることでより高性能の武器を作れる可能性があったりするとよかったかも
日本刀とか古刀を芯にして新しい刀を打ってたりしたようですので

クラフターのモチベとしては他にHQ（+1～3）は銘が入るとか欲しいですよね