基本的な回復魔法は全部のヒーラーにつけてしまって、アビリティをバリア系のアビリティを持ってるのか、ダイレクトヒール系のアビリティを持ってるのかで分けてしまった方がバランス取れませんかね？

基本的にどのヒーラーの組み合わせでもヒールは問題なくて、その上でロスが出ないのがピュアとバリアの組み合わせ、ということにしてしまえばいいのではないかと思います。