ツールを使って計測した火力を外部サイト(fflogs)に、本人の承諾なしにアップロードされるという
状況が非常に不愉快なんですが、こういうのって通報した場合対処はしてもらえるものなんでしょうか？

ツールの使用の是非については最早議論するだけ無駄だと思うのですが、使用者本人のみの火力をアップロードするならともかくとして巻き込んで他者の火力までアップロードするというのは個人で楽しむという範疇を超えているのではないかと思うのです。