Und mal blatant aus dem FF Wiki kopiert:

"Omega Weapon (オメガウェポン, Omega Wepon?), is a recurring superboss in the Final Fantasy series. Though named similarly to another recurring superboss called Omega, the two are distinct: Omega Weapon is based on a Weapon creature introduced in Final Fantasy VII, whereas Omega is a war machine that often has interdimensional properties."

Und wie man hier sehen kann, fallen Proto-Omega und Omega Mark XII unter die Kategorie Omega und nicht Omega Weapon. Wenn ihr nur meinen Worten nicht glaubt.