新しく覚えたスキルはHBの空き枠に自動的にセットされる仕様ですが、そのままではかなり使いにくいため、自分好みの配置に入れ替えている人が大多数だと思われます。
しかし、ジョブをはじめて開放した際、クラスとジョブでHBが別なことにより、自分が調節した並びが全て消え、初期配置のごった煮状態に戻ってしまいます。

HBcopyコマンドを知っていれば簡単に対応できることではありますが、ジョブを始めた開放した段階の初心者がこれを知ることは難しいでしょう。
クラスとジョブを何度も着替えてHBの差を直すのはかなりめんどくさいですし、HBがバグってしまったと勘違いする人もしばしば見かけます。

なので、ジョブの初回開放時に限り、自動的に該当クラスからHB内容をコピーするようになってほしいです。