ぼくはFLやらないので、他のゲームの経験になるので的外れなら申し訳ないのですが…。

単独行動こそチームプレイだと思いますよ。
単独行動している間のチームメンバーは一人欠けた状態で行動するわけですから、守り主体の行動をお願いしなければなりません。
逆に単独行動している忍者に向かって大勢が掛かってくる様であれば他が手薄になるのでそこを攻めるよう、密に連携を取り合わなければならないと思います。