クラフターによって装備に個性が出すことができるのは素晴らしいと思います。
ただ、(FF11を例に出してしまいますが)メイジャンの試練のようなものになってしまうのは少しイヤな気もします、元の装備と、素材によるルート分岐だけ、といった形ではなく、自分で細かいところまで調整できるようなものであればとても良いと思います、もちろんバトルシステムとかとの兼ね合いで調整が難しそうですが・・
それと、個人的な意見なので聞き流してくれて構わないのですが、マテリアという名称を使うのはとても良いと思うのですが、マテリア=魔石という考えなのは少しイヤな感じがします、魔石は魔石でどこか別の場所で使ってくれると嬉しいです、魔石って言葉をマテリアに置き換えているのでしたら個人的には少し違う気がします、どうしても、マテリアという言葉よりも魔石のほうが個人的に印象に残っているので・・・