そもそもボスとの戦闘が開始されたあと、出られなくするのはわかりますが、入れなくする理由がよくわからないですね。

出られてしまうと、ボスをひっぱり出されてステージ上のギミックが意味なくなったりダンジョン中をマラソンされたり
逆にボスがステージから出てこられない仕様だとそれを利用して外で回復したり立て直したりできてしまうので
出られなくすることには納得できるのですが。

入れなくする理由は考えてもよくわからないですね。
戦闘不能になった人がスタート地点からボスステージに戻って戦闘に復帰するのをふせぐくらいだと思いますが
それができたとしても実際にはそのあいだに総崩れになったり、時間経過で攻略不可になったりして
その方法が有効なボス戦ってほとんどないですよね。

それよりスレ主さんがおっしゃるようにザコを締め出すのに悪用されたり
初見さんがムービーみてるあいだに締め出されたりする弊害のほうが大きいのが現状だとおもいます。