強化・弱体を細分化しすぎ問題は、
強化・弱体をいじることが目的なのではなく、
あくまでも異なるカテゴリのアタッカーを混ぜやすくすることなので、
既存の強化・弱体はそのままで、
シナジーボーナスのみで対応するという手も考えられます。
つまり、
異なるカテゴリのアタッカーが組んでいる場合にのみ発生する強化、
という形でもよいのかもしれません。
たとえば、
近接+遠隔であれば、
近接側に命中+、遠隔側に飛命+
魔法+ペットであれば、
魔法側に魔命+、ペット側に本体およびペットの命中+
といった感じで、
混ぜた時の弱点が補えるのであれば、それでOKな気はします。
これはこれで調整は難しいと思いますけども。