ＡＦの再取得をしていらっしゃる点が、重複しているのでは無いかという疑いの元ですね。
再取得をしていないのなら、重複は有り得ない事なんですけど。
アイテムサーチや預かり帳の中も一度お確かめになってみてはいかがでしょうか。

というより、これ以外の原因となると、不具合以外に思いつかないですね。
トレードするアイテムは間違ってませんし…。
あまりお力になれずに申し訳ない。