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師範レベルの複数スキルを必要とするレシピ導入の予定はない、という前提での話ですが、もし二種以上のスキルを100に出来るようになったとして、倉庫キャラのスキルが削除されたりはしないようですし、今まで費やしたポイント等は無駄になる訳ではないと思うのですが、その辺どうなのでしょう？

とはいえ合成を本格的にやってる人の話を聞くと、倉庫がそれぞれスキル100持ちとか割と居るようですね。
確かに1キャラで何でも出来るスーパーマンではないですが、自分独り(手持ちの垢)だけで合成を全て完結出来るのであれば、どっちもあんまり変わらないなーという気もします。