情報不足に分類されてしまいましたが、再現できたようです。
プラットフォーム：Windows
発生日時：2014年1月11日 09:15頃
発生頻度：以前にも発生。再現を確認
キャラクター名：僕
ワールド名：Shiva
エリア名：アル・タユ
モンスター名：Aw'euvhi
手順：
1. テレポ岩のエリアから移動する3箇所のアル・タユ（ホラ、デム、メアの順）でAw'euvhiを討伐してみました。
2. うち、ホワイトカードとレッドカードは入手直後だいじなもの一覧に「未確認」の状態で、
3. ブラックカードは入手直後だいじなもの一覧に「確認済み」の状態で表示されました。
4. ブラックカードを入手後、その状態で他のエリアに移動したところブラックカードの黄色いマーク（未確認状態のしるし）が復活しました。
討伐後、2、3の操作に要した時間が影響しているような気もします。
どのカードも以前に一度ならず入手（及び確認）したことがあります。