HORIのSwitch用コントローラー使ってます。
・NSW-001 [ホリパッド for Nintendo Switch]
OS上でHORIPAD Sと表示されていて、正常動作中。
XInputでない方が良いかもしれません。
古いゲームに新しいコントローラーの組み合わせなのでDirectInputの方がうまく行きそうに思えます。
GAMEPAD Configの右上パッドオプションで、無効にしてみてはいかがでしょうか？
私はForceFeedBack機能もいらないので、その2つを切っています。
あと、Xboxのワードで思いつくのは、Steamを使用していると、
（ゲームパッド非対応や、Xboxサポートの機能があるので）
古いゲームで（ゲーム内で割り当てたキーと）重複して入力が行われてしまうことがあり、FFXIはそれに該当します。
ですので、FFXIをプレイする際にはSteamの常駐を切断するか、
設定→コントローラ→デスクトップ設定の、キー割り当てをすべて解除する必要があると思います。