他のネトゲだとランチャで解像度設定するのが多いですがゲーム内でやってるのなかったかなぁ?「無理」ってほど難しそうなイメージは無いのですが(「スクエニじゃ」とつくのであれば納得? フルスクリーンのロストから立ち直れないレベルですからねぇ)
ネトゲではないですが3Dエロゲでゲーム中に解像度、AA設定、被写界深度、ブルーム、セルフシャドウ、フルスクリーン/ウィンドウ等設定できるものもあります。技術的に不可能ってことはなさそうです。
追記)マビノギ英雄伝ではタイトル画面(船が海の上を進んでいく3D表示)で解像度変更していました。どこまで設定できるのかはアンインストールしたのでわかりません。